Dans "Tenchu : Dark Secret", l'histoire se déroule dans le petit village frontalier de Saiga, situé à la périphérie nord du domaine du Seigneur Matsunoshin Gohda. Rikimaru et Ayame arrivent en ville et sont témoins d'une noble, la princesse Shizu, blessée par une flèche lors d'un raid de bandits. Ils interviennent et chassent les bandits, confirmant l'identité de la femme comme étant la princesse Shizu, mariée au seigneur Kagemasa de la province de Hakkaku. Le mariage était une alliance politique entre Hakkaku et l'Akama voisin, dirigé par le Seigneur Tokiyori, un allié du Seigneur Gohda. Cependant, la princesse Shizu s'est échappée de Hakkaku et s'est réfugiée à Saiga.
